Внутривидовая трансформация у Cl. perfringens стала возможной с одним штаммом D (213), компетентные клетки которого воспринимали ДНК от других типов и штаммов Cl. perfringens — B (LD-1), B (LD-4), D (91), D (213), D (218). Cl. perfringens D (213) воспринимал ДНК и трансформировался как от собственного, гомологичного штамма, так и от негомологичных штаммов других типов. Сохраняемость индуцируемой устойчивости трансформантов проверяли путем нескольких пассажей на жидкой питательной среде без антибиотика, с последующим посевом на плотную среду с концентрацией стрептомицина — 1000 ед/мл. При этом отмечалось наследственное закрепление резистентности к антибиотику — от 4-х — 6-ти месяцев до 2-х лет. Затем происходила утрата устойчивости и возвращение к исходному. Следовательно, устойчивость бактерии к антибиотикам не является тупиковым состоянием, и те антибиотики, которые стали непригодными, после реверсии с успехом можно применять для лечения; к тому же человечество лучшего средства против инфекционных заболеваний пока еще не создало.
Ключевые слова: ДНК, клетка, частота трансформации, глюкозо-кровяной агар, концентрация стрептомицина, концентрация ДНК, антибиотик, штамм, внутривидовая трансформация, поверхность агара, трансформация.
Между бактериями найдено несколько способов передачи биологических свойств — трансформация, конъюгация и трансдукция. Трансформация — когда перенос различных свойств осуществляется свободной ДНК, выделенной из клеток донора. В результате появляются рекомбинанты (трансформанты) — клетки, принявшие от донора те или иные детерминанты (биологические свойства).
Для выделения ДНК использовали стрептомициновые мутанты (резистентные к высоким концентрациям стрептомицина) Cl. perfringens В (LD-1) M, D (213) M и D (218) M. В качестве реципиентов брали исходные штаммы типа В (LD-1), В (D-4), D (91), D (213) и D (218). Из пяти штаммов, взятых в качестве реципиентов, способных к трансформации оказался только один — Cl. perfringens D (213). Стрептомициноустойчивые варианты выделяли методом Г. Кудлай (1950), Сцибальского и Бринзона (1952). С помощью этих методов были получены варианты Cl. perfringens, устойчивые к следующим концентрациям антибиотика: B (LDI-1) — к 10000 ед/мл и D (213, 218) — к 12000 ед/мл. Эти штаммы использовались в качестве доноров.
Изолирование ДНК проводили по методике Мармура (1961). В методике опускали добавление лизоцима, достаточно было замораживание до -3, -5оC на 18–24 часа и добавление додецилсульфата натрия. Депротеинизацию лизированной культуры проводили хлороформизоамиловым спиртом. Нуклеиновые кислоты осаждали этиловым спиртом. ДНК не освобождали от РНК, с той целью, чтобы не травмировать молекулы ДНК. ДНК растворяли в 0,15 М NaCl, 0,015 М цитрат Na, а также в физиологическом растворе NaCl.
Компетентные клетки реципиентов получали охлаждением при +40С на 16–18 часов. Это делалось для того, чтобы слегка повредить оболочку реципиентных клеток для облегчения проникновения донорной ДНК.
Таблица 1
Внутривидовая трансформация уCl. Perfringens
Штаммы доноров ДНК |
Ш т а м м ы р е ц и п и е н т о в |
||||
Количество трансформантов на 0,2 мл инокулята |
|||||
B (LD-1) |
B (LD-4) |
D (91) |
D (213) |
D (218) |
|
B (LD-1) M |
0 |
0 |
0 |
172 |
0 |
D (213) M |
0 |
0 |
0 |
202 |
0 |
D (218) M |
0 |
0 |
0 |
198 |
0 |
Как видно из таблицы 1, штамм Cl. perfringens типа D (213) воспринимал ДНК и трансформировался как от собственного гомологичного штамма, так и от негомологичных штаммов других типов Cl. perfringens. При нескольких повторностях опыта трансформацию получали только со штаммом D (213). При сравнении опытных и контрольных чашек отмечали рост единичных колоний на контрольных чашках. но их число было на несколько порядков ниже опытных. Число трансформантов намного превышало число спонтанных мутантов.
Трансформанты, как правило, запаздывали в росте; колонии обычно появлялись через 48–72 часа. Колонии трансформантов заметно отличались от исходных, имели плоскую, шероховатую с зазубренными краями форму. Гемолиз был хорошо выражен. При микроскопии наблюдали грамположительные или неравномерно окрашенные длинные переплетающиеся нити. Такая форма клеток исчезала при первом же пересеве на бульон Китт-Тароцци, и они принимали нормальную палочковидную форму, характерную для Cl. perfringens.
Таблица 2
Трансформация со штаммом Cl. perfringens D (213)
Штамм реципиент D(213) исходный. Количество жизнеспособных клеток в одном мл — 3х107 |
ДНК из стрептоми-цинорезис-тентного ва-рианта D(213) М в концен-трации 1,6 мкг/мл |
Количество колоний на чашках. Объем инокулята — 0,2 мл, концентрация стрептомицина в агаре 1000 ед/мл |
Частота встречае-мости трансфор-мантов в % |
|||||
№ чашек |
||||||||
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
||||
0,9 мл D (213) + |
0,1 мл ДНК |
236 |
173 |
240 |
216 |
184 |
0,0035 |
|
0,9 мл D (213) + |
0,1 мл буфер |
2 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0,00001 |
|
0,9 мл D (213) + |
0,1 мл ДНК обработанная ДНК-азой |
3 |
2 |
3 |
1 |
1 |
0,00008 |
|
- |
высев ДНК с D(213) М |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
- |
|
Сохраняемость индуцируемой устойчивости трансформантов проверяли путем нескольких пассажей на жидкой питательной среде без антибиотика с последующим посевом на плотную среду с концентрацией стрептомицина 1000 ед/мл. При этом отмечалось наследственное закрепление резистентности к антибиотику. Частоту трансформации мы определяли, исходя из общего числа жизнеспособных клеток в 1 мл питательной среды. Из таблицы 2 видно, что частота трансформации 3 х 107 жизнеспособных клеток составила 0,0035 %; этот показатель, в основном, сохранялся и в других опытах при изучении оптимальных условий трансформации.
Зависимость частоты трансформации от концентрации донорной ДНК
Частота трансформации зависит от концентрации ДНК. Выход трансформантов увеличивается линейно с повышением концентрации ДНК до определенного уровня, за которым следует понижение образования трансформантов. Исходя из предварительных опытов выбрали следующие уровни концентрации ДНК — 0,2; 0,4; 0,7; 1,5; 3 и 5 мкг/мл.
Компетентные клетки получали двумя способами — охлаждением и замораживанием. Замораживание вели при -700С на 10 минут, охлаждение — при +40С на 16 часов. К замороженным культурам после оттаивания при 370С добавляли ДНК str r штамма D(213) М в указанных концентрациях, также поступали и с охлажденной пробой. Количество жизнеспособных клеток в замороженной культуре было — 8х106 на мл, в охлажденной — 2х107 клеток на мл. Действие ДНК прерывали ДНК-азой после 30-минутной инкубации. Пробы как опытные, так и контрольные инкубировали дополнительно 4 часа, затем по 0,2 мл инокулята наносили на поверхность глюкозо-кровяного агара с концентрацией стрептомицина 1000 ед/мл. Чашки инкубировали в анаэростатах при температуре 370С в течение 44 часов.
Результаты опыта на трех повторностей приведены в таблице 3.
Таблица 3
Зависимость частоты трансформации от концентрации ДНК
Концентрация ДНК мкг/мл |
Трансформанты от замороженных проб |
Трансформанты от охлажденных проб |
||
количество жизнеспособных клеток — 8х106 на 1 мл |
количество жизнеспособных клеток — 2х107 на 1 мл |
|||
число трансфор-мантов на 0,2 мл |
частота встречае-мости в % |
число трансфор-мантов на 0,2 мл |
частота встречае-мости в % |
|
0,2 |
84 |
0,005 |
180 |
0,004 |
0,4 |
112 |
0,007 |
240 |
0,006 |
0.7 |
142 |
0,009 |
260 |
0,006 |
1,6 |
130 |
0,008 |
246 |
0,006 |
3 |
88 |
0,005 |
218 |
0,005 |
5 |
32 |
0,002 |
146 |
0,003 |
Как видно из таблицы, наибольшее число трансформантов было получено при концентрации ДНК — 0,7 мкг/мл. Частота трансформации выше в тех сериях проб, в которых компетентные клетки получали путем замораживания, она составила 0,009 %; в сериях проб с охлаждением — 0,006 %.
Сравнительные исследования трансформации на жидкой итвердой питательных средах
Культура исходного штамма Cl. Perfringens D (213) 18-часового роста на МППБ переносилась в свежий бульон Китт-Тароцци и инкубировалась 4 часа; после этого срока культуру разбавляли 1:10 минимальной средой, инкубировали дополнительно 1 час, а затем охлаждали до +40С на 16 часов, затем использовали для трансформации.
Посевы проводились на глюкозо-кровяном агаре без стрептомицина. В одну серию чашек ДНК и компетентные клетки смешивались непосредственно на поверхности агара следующим образом. Перед посевом культуры на поверхность агара наносили одну каплю ДНК в концентрации 800 мкг/мл и втирали с помощью шпаделя; сюда же добавляли компетентную культуру — 0,05 мл; таким образом непосредственно на поверхность агара смешивались ДНК и компетентные клетки реципиента.
Параллельно бульонную культуру компетентных клеток смешивали с ДНК в пробирке (0,1 мл ДНК + 0,9 мл культуры) при концентрации ДНК 1,6 мкг/мл. Смесь ДНК и компетентная культура инкубировалась 20 минут, а затем добавляли ДНК-азу в концентрации 50 мкг/мл, инкубировали еще 4 часа и смесь высевали в другую серию чашек — глюкозо-кровяной агар без антибиотика в объеме 0,05 мл.
В опыте были использованы следующие контроли: 1) компетентные клетки + буфер; 2) ДНК инактивированная ДНК-азой + компетентные клетки; 3) только компетентные клетки для подсчета жизнеспособных особь и 4) контроль на стерильность ДНК.
Все чашки с обеих серий опыта инкубировались в анаэростатах при 370С в течение 20 часов, затем с каждой чашки снимали отпечатки методом реплик по Ледербергу (1952) на селективную среду (глюкозо-кровяной агар с концентрацией стрептомицина 1000 ед/мл). Колонии, выросшие на исходных чашках, переносились на лоскут бархата путем легкого прижимания к поверхности агара с выросшими колониями на ткань; затем на бархат с отпечатанными колониями накладывали чашки со свежей селективной средой (глюкозо-кровяной агар со стрептомицином 1000 ед/мл), таким образом получали втричные чашки-реплики, которые инкубировали в анаэростатах при 370С в течение 48 часов.
В трех повторносей приводим результаты одного опыта без изменений, так как существенной разницы в частоте трансформации не наблюдали. Для каждой серии опытов приводим таблицы отдельно, чтобы более наглядно представить разницу (см. Таблицы 4 и 5).
Таблица 4
Трансформация втвердой среде сприменением метода реплик (1)
Опыт |
Контроль |
||||
№ чашек |
Выросло транс-формантов на 0,05 мл |
Частота встре-чаемости в % |
№ чашек |
Выросло колоний на 0,05 мл |
Частота встре-чаемости в % |
1 |
21 |
1 |
- |
||
2 |
31 |
2 |
- |
||
3 |
18 |
3 |
1 |
||
4 |
15 |
0,005 |
4 |
1 |
0,00008 |
5 |
17 |
5 |
- |
||
6 |
16 |
||||
7 |
53 |
||||
8 |
16 |
||||
M |
23,4 |
M |
|||
m± |
4,6 |
m± |
|||
Для всех исследований р <0,001 Примечание: число жизнеспособных клеток — 9х106 на мл
Таблица 5
Трансформация вжидкой среде сприменением метода реплик (2)
О п ы т |
К о н т р о л ь |
||||
№ чашек |
Выросло транс-формантов на 0,05 мл |
Частота встре-чаемости в % |
№ чашек |
Выросло колоний на 0,05 мл |
Частота встре-чаемости в % |
1 |
27 |
1 |
- |
||
2 |
36 |
0,008 |
2 |
1 |
|
3 |
39 |
3 |
- |
||
4 |
23 |
4 |
- |
0,00005 |
|
5 |
30 |
5 |
- |
||
M |
M |
0,4 |
|||
m± |
m± |
0,15 |
|||
Для всех исследований р< 0,001 Примечание: число жизнеспособных клеток — 9х106 на мл
Из этих таблиц (4, 5) видно, что трансформация более интенсивно идет в жидкой среде, причем прекращение действия ДНК ДНК-азой после 20-минутного контакта с компетентной культурой увеличивает выход трансформантов. Однако, существенной разницы в частоте трансформации в обоих сериях опытов нет; в первом случае она составляет 0,005 и во втором — 0,008. Следует отметить, что трансформация на твердой среде очень удобна для проверки биохимической активности ДНК, а также для выявления новых трансформабельных штаммов.
Таким образом, трансформация на твердой среде является удобной. Для Cl. perfringens метод реплик в осуществлении трансформации как в жидкой, так и в твердой средах, а также как в аэробных, так и в анаэробных условиях представляется очень удобной, так как стадия необратимого поглощения клетками ДНК происходит успешно в обоих указанных условиях их культивирования.
Стрептомицинорезистентность и гемолитические свойства, помимо локализации в плазмидной ДНК, включены в хромосому клетки клостридий и эти два признака чаще переносятся совместно, т. к. при замораживании они не элиминируются и переносятся в клетки реципиента участки хромосомы, в которой локализованы.
Что касается устойчивости к стрептомицину, ее можно обобщить и сделать заключение, что устойчивость к антибиотикам сохраняется от 4-х — 6-ти месяцев до 2-х лет, затем возвращается к исходному состоянию — универсальный закон всех живых организмов. Однако, то время когда бактерии являются резистентными (мутанты) к антибиотикам, превращает их непригодными для лечения, но все же устойчивость бактерии к антибиотикам не является состоянием тупиковым — происходит реверсия мутантных клеток, возврат к изначальному состоянию.
Внутривидовая трансформация намного уступает конъюгации, она осуществлется между далеко стоящими (на таксономической лестнице, видами и родами, бактерий, E.coli, стафилококки, стрептококки и др. — трансформация же происходит, преимущественно, внутри вида, этому способствует то, что плазмидная ДНК, в процессе выделения хромосомной ДНК-элиминируется, переносятся те признаки, которые связаны с хромосомой — резистентность к антибиотикам и гемолитическая активность. Элиминации плазмидной ДНК способствует и додецилсульфат натрия, применяемый при выделении ДНК.
У Cl. perfringens токсигенность несет плазмидная ДНК, т. е. токсигенные свойства определяет плазмида. так или иначе, передача антибиотикорезистентности настолько важна для макроорганизма, что при внедрении в организм возбудителя, многие антибиотики непригодны по назначению, но среди множества антибиотиков можно выбрать пригодный для лечения; вместе с этим хочу отметить следующее — человечество лучшего средства для лечения инфекционных заболеваний не создало.
Представляем фотоснимки:
- ДНК, выделенная из стрептомицинорезистентного варианта Cl. perfringens; ДНК осаждена этанолом (верхний слой), переносится в жидкость следующего состава: 0,15 М NaCl и 0,015 М цитрат Na, также в физиологическом растворе NaCl — ДНК моментально растворяется.
- Ультраструктура исходнoй культуры Cl. perfringens D (213) х 80000, без воздействия стрептомицина
- Колонии авирулетного стрептомицинорезистентного варианта Cl. perfringens D (213) на глюкозном агаре
- Ультраструктура авирулентного стрептомицинорезистентного варианта Cl. perfringens штамм D (213) х 80000.
- Ультраструктура трансформированного варианта Cl. perfringens штамма D (213) х 80000
- Колонии трансформантов Cl. perfringens штамма D (213) на глюкозно-кровяном агаре
- Колонии трансформантов Cl. perfringens штамма D (213) на глюкозно-кровяном агаре
Представленные фотоснимки свидетельствуют о том, что антибиотик в высоких концентрациях, при длительном воздействии, превращает клетки Cl. perfringens в R-форму. Сравнивая с исходной клеткой, хромосома (нуклеоид) мутантной клетки фрагментирован, и ДНК, выделенная из таких клеток и внесенная в суспензии исходных клеток, вызывает подобные изменения нуклеоида, — происходит трансформация; некоторые клетки с гемолизом. Эти два признака передаются совместно, но более с высокой частотой — устойчивость к антибиотику. Они локализованы в локусах нуклеоида на близком расстоянии. Что касается токсигенности, она локализована в плазмидной ДНК, которая содержится в цитоплазме автономно и при воздействии замораживания, додецилсульфата натрия, либо антибиотика — происходит элиминация ее. Поэтому при трансформации токсигенность не передается; передача возможна при применении более щадящих методов выделения ДНК.
Литература:
- Начкебия Д. В. Влияние антибиотиков на свойства возбудителей анаэробных инфекций //Ветеринария, № 9, 1972.
- Начкебия Д. В. Изучение трансформации у микроорганизмов Cl. perfringens //Ветеринария, № 6, 1973.
- Начкебия Д. В. Влияние некоторых физических и химических факторов на свойства Cl. perfringens //Бюлл. ВИЭВ, в.ХVI, 1973.
- Кудлай Д. Г. Резистентность к стрептомицину брюшно-тифозных бактерий //В сб. тр. Акад. Мед. Наук СССР, 1980, с. 63.
- Спирин А. С. Биохимия, т.23, с.656, 1958.
- Тришкина Е. Т. Методы оценки устойчивости микроорганизмов к антибиотикам //Бюлл. ВИЭВ, 1970, в. 8, с. 99.
- Marmur J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms. J. Molec. Biol., 1961, 3, 208.
- Szybalski W., Brjson V. J. bacteriol, 1952, 64, 489.
- Lederberg E. M., Cohen S. N. Transformation of typhimurium bi plasmid deoxyribonucleic acid // J. Bact. — 1974. — v. 119. — 1072–1075.